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@@ -1,6 +1,6 @@
1
  ---
2
- language:
3
- - es
4
  tags:
5
  - biomedical
6
  - clinical
@@ -8,6 +8,7 @@ tags:
8
  - spanish
9
  - occupations
10
  - professions
 
11
  license: apache-2.0
12
  metrics:
13
  - precision
@@ -15,7 +16,6 @@ metrics:
15
  - f1
16
  base_model:
17
  - PlanTL-GOB-ES/bsc-bio-ehr-es
18
-
19
  model-index:
20
  - name: BSC-NLP4BIA/prof-ner-es
21
  results:
@@ -25,24 +25,31 @@ model-index:
25
  name: MEDDOPROF
26
  type: MEDDOPROF
27
  metrics:
28
- - name: precision (micro)
29
- type: precision
30
- value: 0.785
31
- - name: recall (micro)
32
- type: recall
33
- value: 0.776
34
- - name: f1 (micro)
35
- type: f1
36
- value: 0.780
37
  widget:
38
- - text: "El diagnóstico definitivo de nuestro paciente fue de un Adenocarcinoma de pulmón cT2a cN3 cM1a Estadio IV (por una única lesión pulmonar contralateral) PD-L1 90%, EGFR negativo, ALK negativo y ROS-1 negativo."
39
- - text: "Durante el ingreso se realiza una TC, observándose un nódulo pulmonar en el LII y una masa renal derecha indeterminada. Se realiza punción biopsia del nódulo pulmonar, con hallazgos altamente sospechosos de carcinoma."
40
- - text: "Trombosis paraneoplásica con sospecha de hepatocarcinoma por imagen, sobre hígado cirrótico, en paciente con índice Child-Pugh B."
41
-
 
 
 
 
 
 
 
42
  ---
43
 
44
 
45
- # Spanish RoBERTa-base biomedical model finetuned for the Named Entity Recognition (NER) task on the MEDDOCAN dataset.
46
 
47
  ## Table of contents
48
  <details>
@@ -64,7 +71,7 @@ widget:
64
  </details>
65
 
66
  ## Model description
67
- A fine-tuned version of the [bsc-bio-ehr-es](https://huggingface.co/PlanTL-GOB-ES/bsc-bio-ehr-es) model on the [MEDDOPROF](https://zenodo.org/records/7116201) corpus (original Spanish version).
68
 
69
  For further information, check the [official website](https://temu.bsc.es/meddoprof/).
70
 
@@ -81,7 +88,9 @@ At the time of submission, no measures have been taken to estimate the bias embe
81
  The model was trained using the Barcelona Supercomputing Center infrastructure.
82
 
83
  ## Evaluation
84
- F1 Score: 0.780 on MEDDOPROF (Spanish)
 
 
85
 
86
  ## Additional information
87
 
 
1
  ---
2
+ language:
3
+ - es
4
  tags:
5
  - biomedical
6
  - clinical
 
8
  - spanish
9
  - occupations
10
  - professions
11
+ - employment
12
  license: apache-2.0
13
  metrics:
14
  - precision
 
16
  - f1
17
  base_model:
18
  - PlanTL-GOB-ES/bsc-bio-ehr-es
 
19
  model-index:
20
  - name: BSC-NLP4BIA/prof-ner-es
21
  results:
 
25
  name: MEDDOPROF
26
  type: MEDDOPROF
27
  metrics:
28
+ - name: precision (micro)
29
+ type: precision
30
+ value: 0.785
31
+ - name: recall (micro)
32
+ type: recall
33
+ value: 0.776
34
+ - name: f1 (micro)
35
+ type: f1
36
+ value: 0.78
37
  widget:
38
+ - text: >-
39
+ El diagnóstico definitivo de nuestro paciente fue de un Adenocarcinoma de
40
+ pulmón cT2a cN3 cM1a Estadio IV (por una única lesión pulmonar
41
+ contralateral) PD-L1 90%, EGFR negativo, ALK negativo y ROS-1 negativo.
42
+ - text: >-
43
+ Durante el ingreso se realiza una TC, observándose un nódulo pulmonar en el
44
+ LII y una masa renal derecha indeterminada. Se realiza punción biopsia del
45
+ nódulo pulmonar, con hallazgos altamente sospechosos de carcinoma.
46
+ - text: >-
47
+ Trombosis paraneoplásica con sospecha de hepatocarcinoma por imagen, sobre
48
+ hígado cirrótico, en paciente con índice Child-Pugh B.
49
  ---
50
 
51
 
52
+ # PROF-NER-ES
53
 
54
  ## Table of contents
55
  <details>
 
71
  </details>
72
 
73
  ## Model description
74
+ A fine-tuned version of the [bsc-bio-ehr-es](https://huggingface.co/PlanTL-GOB-ES/bsc-bio-ehr-es) model on the [MEDDOPROF](https://zenodo.org/records/7116201) corpus (original Spanish version) for professions/jobs (PROFESION) and employment status (SITUACION_LABORAL).
75
 
76
  For further information, check the [official website](https://temu.bsc.es/meddoprof/).
77
 
 
88
  The model was trained using the Barcelona Supercomputing Center infrastructure.
89
 
90
  ## Evaluation
91
+ Micro F1 Score: 0.780 on MEDDOPROF (Spanish)
92
+ PROFESION F1 Score: 0.853
93
+ SITUACION_LABORAL F1 Score: 0.645
94
 
95
  ## Additional information
96